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微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息

更新時間:2017-09-21  |  點擊率:1463

  近日,中國科學院昆明動物研究所張亞平課題組與吳東東課題組合作,通過比較野生褐家鼠和實驗大鼠的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),解析了實驗大鼠的起源和馴化遺傳機制。相關(guān)研究成果發(fā)表在Molecular Biology and Evolution上。本文締一生物/締一生物為您分析微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息

   A.大豆灰斑菌的侵染循環(huán);B-D.大豆灰斑病病癥及菌絲侵染特點;

  E.灰斑菌基因組的Circos-plot分析;F.致病基因簇

  實驗大鼠作為一種廣泛使用的模式動物,由野生褐家鼠馴化而來,也是一種家養(yǎng)動物。與其野生祖先褐家鼠相比,實驗大鼠在形態(tài)、行為及生理方面發(fā)生很大變化,但實驗大鼠的起源以及導致其被馴化成功的機制尚不清楚。

  研究人員利用群體遺傳學方法,F(xiàn)ST與cross-population extended haplotype homozygosity (XP-EHH)等,在全基因范圍內(nèi)掃描了野生褐家鼠與實驗大鼠群體之間出現(xiàn)分化的區(qū)域,發(fā)現(xiàn)大量神經(jīng)系統(tǒng)基因在大鼠馴化過程中受到人工選擇作用,例如,在學習記憶方面起重要作用的FOXP2和B3GAT1,以及節(jié)律相關(guān)基因CLOCK。這些基因在實驗大鼠的神經(jīng)組織中的表達水平顯著上調(diào),有助于提高學習記憶能力。研究人員推測學習記憶能力的提高可能是實驗大鼠被馴化的關(guān)鍵。此外,基于轉(zhuǎn)錄組分析及qPCR數(shù)據(jù)揭示能量代謝相關(guān)基因在實驗大鼠大腦組織中顯著上調(diào),這為進一步揭示實驗大鼠馴化的遺傳機制奠定了良好的基礎(chǔ)。

  該研究得到中科院先導B項目的資助。綜上所述,您是不是已經(jīng)對微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息,有所了解。如果還有其他疑問,請咨詢締一生物/締一生物資深專家。

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